Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113Q902F9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113Q902F9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms