Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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