Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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