Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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