Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms