Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUFY3Q7L099 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUFY3Q7L099 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms