Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms