Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms