Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms