Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF544Q6NX49 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms