Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms