Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms