Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms