Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms