Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms