Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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