Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms