Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ASIC2Q16515 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASIC2Q16515 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms