Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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