Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms