Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDCD1Q15116 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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