Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RAB3GAP1Q15042 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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