Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1D2Q14995 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms