Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE4AQ14139 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE4AQ14139 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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