Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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