Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCINQ13939 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCINQ13939 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCINQ13939 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCINQ13939 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCINQ13939 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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