Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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