Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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DNASE1L3Q13609 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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DNASE1L3Q13609 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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DNASE1L3Q13609 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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DNASE1L3Q13609 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms