Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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