Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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