Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms