Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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