Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms