Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms