Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DHX9Q08211 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms