Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms