Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms