Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF11Q05519 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms