Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms