Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms