Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms