Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms