Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2P78314 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2P78314 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP2P78314 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SH3BP2P78314 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SH3BP2P78314 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2P78314 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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