Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD2P62316 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms