Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC4P59998 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms