Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPAP53621 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPAP53621 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPAP53621 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPAP53621 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPAP53621 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPAP53621 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms