Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVDP53602 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVDP53602 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MVDP53602 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms