Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms