Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms