Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms